Após o sorteio dos grupos, ficaram definidas as regras do Campeonato Paulista de 2016. A principal mudança será na quantidade de clubes rebaixados.
Seis clubes caíram para a série A2 em 2016. Enquanto isso, apenas dois subirão da série A2, para que, em 2017, apenas 16 clubes participem do torneio.
Não foi definido, contudo, como serão escolhidos os clubes rebaixados. Muito provavelmente, os seis piores ao término da primeira fase cairão.
O torneio ainda terá um limite de 28 inscritos por clube, sendo 25 jogadores de linha e três goleiros. Contudo, uma nova regra será colocada no torneio deste ano.
Clubes da série A1 não poderão contratar treinadores de outras equipes da série A1 durante o torneio. Assim, cada treinador só poerá dirigir um clube durante a competição.
Além disso, os clubes só poderão contratar um novo treinador após uma homologação entre clube e treinador na Federação.
