Competição ainda conta com 32 clubes e agora conta com acréscimo de participantes que chegam da Libertadores
Na edição de 2025 da Copa do Brasil, os 32 times que disputarão a terceira fase já foram definidos. Essa etapa reúne os clubes que garantiram vaga direta via Libertadores, títulos da Série B e Copa Verde ou boa colocação no Brasileirão pasado.
A partir desse momento, a CBF promoverá um sorteio para determinar os confrontos, que serão realizados em jogos de ida e volta nos dias 30 de abril e 21 de maio.
POTE 1
POTE 2
Os potes para o sorteio são organizados com base no Ranking Nacional de Clubes (RNC). Dessa forma, os times melhor classificados compõem o Pote 1, enquanto os demais são distribuídos no Pote 2.
A partir da terceira fase, em caso de empate no placar agregado das duas partidas, a decisão será tomada por meio de disputa de pênaltis. Nas primeiras fases, as partidas foram de jogo único.